Основными задачами Управления являются:
организация и контроль выполнения мероприятий по предупреждению и ликвидации заразных и незаразных болезней животных, планов ветеринарного обслуживания животноводства на территории Республики Северная Осетия-Алания;
охрана Населения от болезней общих для человека и животных;
охрана территории Республики Северная Осетия-Алания от заноса заразных болезней животных из близлежащих регионов и иностранных государств;
контроль за соблюдением должностными лицами, предприятиями, учреждениями, организациями, иными хозяйствующими субъектами независимо от их подчиненности и форм собственности, общественными объединениями, международными организациями, иностранными юридическими лицами, гражданами Республики Северная Осетия-Алания и лицами без гражданства - владельцами животных и продуктов животноводства, ветеринарного законодательства, предусматривающего дисциплинарную, административную, уголовную и иную ответственность;
взаимодействие с учреждениями и организациями ветеринарии независимо от форм собственности, находящимися на территории Республики Северная Осетия-Алания;
организация и повышение эффективности государственного ветеринарно-санитарного надзора;
обеспечение, совместно с органами государственного надзора, контроля за качеством выпускаемых, а также ввозимых продовольственных товаров, безопасных в ветеринарном отношении для потребителя.