Комплексное управление Программой и распоряжение средствами республиканского бюджета осуществляет субъект бюджетного планирования - Министерство сельского хозяйства и продовольствия Республики Северная Осетия-Алания.
Система управления реализацией Программы:
Ответственным за реализацию Программы в целом, достижение целей, задач Программы, индикаторов, показателей, задач и мероприятий Программы является Министерство сельского хозяйства и продовольствия Республика Северная Осетия-Алания, которое осуществляет:
координацию деятельности подразделений Министерства сельского хозяйства и продовольствия Республики Северная Осетия-Алания, учреждений и организаций, участвующих в реализации Программы, и их согласованных действий по реализации программных мероприятий;
мониторинг реализации Программы.
Финансирование предусмотренных Программой мероприятий будет осуществляться в пределах средств республиканского бюджета, предусмотренных в республиканском бюджете Республики Северная Осетия-Алания на 2009-2012 годы Министерству сельского хозяйства и продовольствия Республики Северная Осетия-Алания на соответствующие мероприятия, в объемах не менее 30% от выделенных средств федерального бюджета.
Правовые основания расходных обязательств республиканского бюджета в финансировании обеспечения мероприятий Программы возникают в результате подписания соглашений между Министерством сельского хозяйства России и Республикой Северная Осетия-Алания о включении ее в число участников Программы.