Текущее управление реализацией Программы осуществляют Министерство здравоохранения Республики Коми и Центр госсанэпид надзора в Республике Коми, которые с учетом выделенных на ее реализацию бюджетных средств ежегодно уточняют целевые показатели и затраты на программные мероприятия и при необходимости вносят в установленном порядке предложения об изменении или продлении сроков реализации отдельных программных мероприятий.
Для обеспечения управления и контроля за реализацией Программы предусматривается создание совета при Минздраве Республики Коми и Центре госсанэпиднадзора в Республике Коми под руководством заместителя министра здравоохранения Республики Коми и Главного государственного санитарного врача по Республике Коми.
Контроль ведется на основании государственной статистической отчетности, заключенных договоров, контрактов, соглашений и включает:
периодическую отчетность исполнителей о реализации программных мероприятий;
контроль за целевым и эффективным использованием выделяемых средств;
контроль за соблюдением сроков и качеством выполнения договоров, контрактов, соглашений, объемов запланированных работ.
Исполнители отчитываются об использовании выделенных им средств и выполнении программных мероприятий в соответствии с порядком, установленным государственными заказчиками.
Совет целевой Программы проводит анализ, обобщение информации о ходе выполнения программных мероприятий и готовит статистическую, справочную и аналитическую информацию о реализации Программы.