Департамент возглавляет заместитель министра сельского хозяйства и продовольствия Республики Дагестан - начальник Департамента по регулированию продовольственного рынка при Министерстве сельского хозяйства и продовольствия РД, назначаемый на должность и освобождаемый от должности Правительством Республики Дагестан по представлению министра сельского хозяйства и продовольствия Республики Дагестан.
Начальник Департамента имеет заместителей, назначаемых на должность и освобождаемых от должности министром сельского хозяйства и продовольствия Республики Дагестан по представлению начальника Департамента.
7. Начальник Департамента:
осуществляет руководство деятельностью Департамента, несет персональную ответственность за выполнение возложенных на Департамент задач и функций;
утверждает структуру и штатное расписание аппарата Департамента в пределах установленных фонда оплаты труда и численности работников, а также смету расходов на его содержание в пределах утвержденных ассигнований;
утверждает положения о структурных подразделениях Департамента;
назначает на должноcть и освобождает от должности в установленном законодательством порядке начальников структурных подразделений и работников аппарата Департамента;
издает в пределах своей компетенции приказы, инструкции и дает указания, обязательные для исполнения всеми работниками Департамента;
представляет в установленном порядке особо отличившихся работников Департамента к государственным наградам;
осуществляет другие полномочия в соответствии с законодательством.
8.Расходы на содержание аппарата Департамента осуществляются за счет средств республиканского бюджета РД, направляемые на содержание органов исполнительной власти Республики Дагестан.
9.. Департамент является юридическим лицом, имеет текущий, бюджетный расчетный и иные, в том числе валютные, счета в учреждениях банков, печать с изображением Государственного герба Республики Дагестан и со своим наименованием, а также соответствующие печати и штампы.