Руководство (министр, первый заместитель, заместители министра)
Отдел экономического анализа, текущих и перспективных программ
Отдел координации и развития железнодорожного, морского и воздушного транспорта
Отдел координации и развития автотранспорта и дорожного хозяйства
Отдел телекоммуникационных систем
Общий отдел