9. Комплексный мониторинг состояния и химического состава поверхностных вод следующих водоемов: озера Виштынецкого, озера Мариново, озера Проточного, реки Красной, реки Писсы.
10. Мониторинг источников антропогенного загрязнения водоемов и зон их влияния на водные объекты.
11. Мониторинг источников антропогенного загрязнения наземной природной среды (побережий водоемов, лесных, болотных, лесоболотных экосистем).
12. Мониторинг форм и интенсивности воздействия туристическо-экскурсионной и рекреационной нагрузки на ключевые природные комплексы.
13. Лесопатологический мониторинг участков старовозрастных широколиственных и хвойных лесов, близких по структуре к первичным. Общий, рекогносцировочный и детальный надзор за основными видами насекомых-вредителей и болезнями на серии пробных площадей, включая проведение феромонного надзора за отдельными видами насекомых.
14. Мониторинг состояния популяций копытных животных. Контроль за динамикой численности косули, кабана, лося, благородного оленя. Определение половозрастной структуры популяции благородного оленя, контроль за динамикой основных популяционных показателей.
15. Мониторинг состояния популяций хозяйственно значимых видов (бобра, выдры, барсука, лисицы, енотовидной собаки, волка, куницы лесной, зайца-русака).
16. Мониторинг состояния редких и особо охраняемых видов. Мониторинг мест распространения редких видов высших растений, лишайников и грибов согласно списку Красной книги Калининградской области. Оценка состояния ценопопуляций в основных местах произрастания видов на территории природного парка.
17. Мониторинг мест распространения редких видов животных согласно списку Красной книги Калининградской области. Оценка состояния видов на территории природного парка.