Выполнение Программы рассчитано на 5-летний период (2011 - 2015 годы). Планировать реализацию Программы на более длительный срок нецелесообразно вследствие динамичности мировых и российских тенденций и приоритетов в области развития высоких технологий.
Предусматривается реализация Программы в один этап. Программа начнет реализовываться сразу после прекращения действия предыдущей программы инновационного развития, при этом должна обеспечиваться возможность непрерывной реализации отдельных программных мероприятий.