Границы муниципального образования Ягоднинского сельсовета на разных участках совпадают с участками границ муниципальных образований: Рыбновского, Чистовского, Парамоновского, Малышевского, Альменевского, Шариповского, Иванковского сельсоветов, Целинного и Мишкинского районов.