Общая протяженность границ муниципального образования - 60.79 км.
Границы муниципального образования Байдарского сельсовета на разных участках совпадают с участками границ муниципальных образований: Булдакского, Васильевского, Новобайдарского, Сумкинского сельсоветов и Варгашинского района.