Общая протяженность границ муниципального образования - 72.63 км.
Границы муниципального образования Карпунинского сельсовета на разных участках совпадают с участками границ муниципальных образований: Мокроусовского, Уваровского, Крепостинского, Семискульского сельсоветов и Тюменской области.