Перед Департаментом ставятся следующие задачи:
2.1. Государственное регулирование и координация развития сельского хозяйства, перерабатывающей промышленности в целях повышения эффективности производства, качества и конкурентоспособности продукции, формирования производственной социальной инфраструктуры, воздействие на производство товаров народного потребления, улучшение ассортимента и качества продукции, улучшение торгового обслуживания населения;
2.2. Обеспечение и контроль за поступлением товаров, материалов по выделенным фондам;
2.3. Содействие развитию рыночных отношений и предпринимательства, осуществление приватизации и демонополизации предприятий в интересах сельскохозяйственных товаропроизводителей и населения округа;
2.4. Подготовка предложений по созданию организационно экономических, финансовых и правовых условий функционирования мелкотоварных секторов в отраслях сельского хозяйства и перерабатывающей промышленности;
2.5. Освоение достижений научно-технического прогресса в агропромышленном производстве и торговле, осуществление государственной технической, технологической, инвестиционной политики, информационно-консультативное обеспечение предприятий АПК;
2.6. Содействие обеспечению социальных гарантий, реализации государственной политики по регулированию доходов, оплаты труда и льгот, разработки и осуществления мер по стимулированию повышения производительности труда работников АПК и торговли;
2.7. Разработка и организация выполнения предприятиями и организациями АПК и торговли округа мероприятий по охране окружающей среды и природных ресурсов, обеспечение экологически безопасного развития сельского хозяйства.
2.8. Государственное регулирование рационального использования земель сельскохозяйственного назначения, государственное регулирование производства, переработки и реализации сельскохозяйственной продукции, сырья и продовольствия, производственно-техническое и материально-техническое обеспечение агропромышленного производства. Осуществление управления в области торговли и общественного питания, координация деятельности в этой сфере иных исполнительных органов государственной власти автономного округа.