Главное управление выполняет следующие функции:
3.1 в области комплексных проблем здравоохранения Чукотского автономного округа:
- участвует в подготовке ежегодного доклада Правительству Чукотского автономного округа о состоянии здоровья населения автономного округа;
- разрабатывает совместно с центральными органами исполнительной власти автономного округа, Чукотским территориальным Фондом обязательного медицинского страхования, на основе федеральных целевых программ, региональные целевые программы в области здравоохранения;
- проводит в установленном порядке экспертизу проектов региональных целевых программ, затрагивающих вопросы охраны здоровья, входящие в компетенцию Главного управления;
- принимает меры по повышению уровня медицинского обеспечения, качества медицинского обслуживания населения автономного округа в рамках федеральных и региональных программ по защите населения округа от воздействия поражающих факторов радиационных и других техногенных аварий;
- содействует созданию и организации деятельности в автономном округе негосударственных предприятий, учреждений и организаций здравоохранения;
- координирует взаимодействие государственной, в том числе ведомственного подчинения, муниципальной и частной систем здравоохранения в Чукотском автономном округе;
- выполняет функции государственного заказчика по региональным целевым программам развития здравоохранения в автономном округе;
- рассматривает предложения, заявления и жалобы граждан, принимает по ним необходимые меры, организует прием граждан по вопросам, отнесенным к его компетенции.
3.2. в области профилактики заболеваний, медицинской помощи, инвалидности, экспертизы:
- обеспечивает совершенствование профилактической, лечебно-диагностической и лечебно-оздоровительной работы;
- развивает сеть лечебно - профилактических учреждений системы здравоохранения Чукотского автономного округа, осуществляет руководство и контроль за их деятельностью;
- организует диспансеризацию и медицинскую реабилитацию лиц, подвергшихся рентгеновскому и радиационному воздействию;
- организует в учреждениях здравоохранения автономного округа диспансеризацию и медицинскую реабилитацию наркоманов и алкоголиков, а также инвалидов;
- принимает участие в пределах своей компетенции в работе по профилактике инфекционных, неинфекционных, паразитарных, особо опасных инфекционных заболеваний, а также профессиональных заболеваний, связанных с неблагоприятным влиянием на здоровье человека факторов среды его обитания;
- организует в установленном порядке работу по направлению детей и взрослых на лечение за пределы автономного округа;
- разрабатывает предложения по оказанию медицинской помощи отдельным социально незащищенным группам населения автономного округа (коренным жителям, детям, пенсионерам, больным отдельными заболеваниями и др.).
3.3. в области охраны семьи, материнства, отцовства и детства:
- разрабатывает и организует выполнение мероприятий, обеспечивающих охрану здоровья матери и ребенка, отца и членов семьи, осуществляет контроль за их выполнением;
- участвует в решении вопросов медико-социальной помощи семье, матери, ребенку и отцу;
разрабатывает предложения и организует выполнение мероприятий, направленных на улучшение питания детей, беременных женщин и кормящих матерей;
3.4. в области медицинской статистики, бухгалтерского учета и информатизации:
- организует работу по ведению статистики в системе здравоохранения автономного округа, осуществляет методическое руководство порядком статистического и бухгалтерского учета и отчетности в учреждениях здравоохранения автономного округа, контролирует достоверность статистической информации;
- осуществляет публикацию материалов о состоянии здоровья населения и деятельности лечебно-профилактических учреждений автономного округа;
обеспечивает формирование единой системы информатизации системы здравоохранения автономного округа.
3.5. в области подготовки, повышения квалификации кадров и научной деятельности:
- разрабатывает и реализует совместно с заинтересованными центральными исполнительными органами государственной власти автономного округа программы кадрового обеспечения здравоохранения автономного округа, организует подготовку и повышение квалификации медицинских и фармацевтических работников;