3.1.Руководство управлением осуществляет его начальник, который назначается на должность и освобождается от должности губернатором области.
3.2.Начальник управления:
-осуществляет руководство деятельностью управления, несет персональную ответственность за выполнение возложенных на управление задач и функций, распределяет обязанности между заместителями начальника управления;
-назначает на должность и освобождает от должности работников управления, утверждает положения о структурных подразделениях управления и устанавливает должностные обязанности работников;
-действует без доверенности при представлении интересов управления в государственных органах представительной и исполнительной власти, органах местного самоуправления, судебных и правоохранительных органах и в организациях;
-расходует полученные из областного бюджета средства строго в соответствии с бюджетной росписью и в пределах установленных лимитов финансирования;
-в установленном порядке заключает государственные контракты (договоры) на поставку товаров, работ, услуг, обеспечивающие функционирование агропромышленного комплекса, только в пределах лимитов бюджетных обязательств и на сумму, не превышающую установленную сметой доходов и расходов на текущий финансовый год в случаях, установленных законодательством области;
-распоряжается в соответствии с действующим законодательством имуществом и средствами, переданными управлению;
-осуществляет иные полномочия в соответствии с законодательством.
3.3.Начальник управления имеет двух заместителей, которые назначаются на должность и освобождаются от должности губернатором области по представлению начальника управления.
В период отсутствия начальника управления заместитель начальника управления, курирующий производственные вопросы, наделяется правом подписи договоров, приказов, распоряжений и иных документов.
3.4. В управлении образуется коллегия в составе начальника управления, его заместителей, специалистов аппарата управления, представителей организаций области (согласованию).
Состав коллегии (кроме лиц, входящих в состав по должности) утверждается начальником управления.
Решения коллегии оформляется протоколами и носят рекомендательный характер.