Государственный заказчик Программы - Администрация Камчатской области контролирует исполнение Программы. Для осуществления текущего управления в процессе реализации Программы, администрацией Камчатской области создается Комиссия по снижению влияния автотранспорта на окружающую среду и здоровье населения, которая является координационным органом, осуществляющим свою деятельность во взаимодействии с главами муниципальных образований городов и районов, предприятиями и организациями, учреждениями и предпринимателями Камчатской области. Основной задачей комиссии является организация и контроль исполнения Программы, ее корректировка и дополнение, а так же координация работ по реализации мероприятий областной государственной целевой программы "По снижению влияния автотранспорта на окружающую среду и здоровье населения Камчатской области".
Государственный заказчик Программы периодически рассматривает материалы о ходе выполнения Программы, заслушивает отчеты исполнителей программных мероприятий, а также проводит проверку целевого использования выделенных средств.