Заработная плата руководителей учреждений, их заместителей и главных бухгалтеров состоит из должностного оклада, выплат компенсационного и стимулирующего характера.
Должностной оклад руководителя учреждения определяется трудовым договором и устанавливается в размере, не превышающем 3-кратного размера средней заработной платы работников, включенных в перечни должностей и профессий работников учреждений, относящихся к основному персоналу.
Должностные оклады заместителей руководителей из числа врачебного персонала устанавливаются на 15 % ниже должностных окладов руководителей этих учреждений, остальных заместителей и главных бухгалтеров - на 25 %.
Разработаны критерии, по которым устанавливается коэффициент кратности, применяемый при установлении должностного оклада руководителю.
Новая система дала большие полномочия руководителям бюджетных учреждений. Руководители медучреждений могут принимать решения о дифференциации заработной платы в зависимости от результатов труда, о персональных доплатах за качество.