Программа призвана способствовать реализации задач, определенных "Концепцией развития агропромышленного комплекса Костромской области на 2001 - 2005 годы", утвержденной Постановлением Костромской областной Думы N 423 от 21 апреля 2002 года. Региональная целевая комплексная Программа "Развитие агропромышленного комплекса Костромской области на период до 2006 года" является координирующей, в рамках которой финансируются однородные мероприятия различных участников Программы.
Основным принципом при группировке служит целевая направленность мероприятий, реализация которых предполагается в период действия Программы. Согласно указанному действию мероприятия группируются в соответствии с основными задачами развития АПК Костромской области.