Основными задачами Управления являются:
2.1. Организация взаимодействия органов исполнительной власти Костромской области с органами местного самоуправления муниципальных образований области по вопросам развития муниципальных образований, привлечения населения к управлению территориями.
2.2. Участие, в пределах своих полномочий, в формировании и совершенствовании правовых, организационных, социально-экономических и финансовых основ развития муниципальных образований.
2.3. Разработка и внесение предложений губернатору области по проведению государственной политики в отношении местного самоуправления.
2.4. Обеспечение взаимодействия администрации области с избирательной комиссией Костромской области при проведении выборных процессов в муниципальных образованиях области.