Департамент в пределах своей компетенции имеет право:
4.1. Привлекать для проработки вопросов, входящих в его компетенцию, высшие учебные заведения, научно-исследовательские и другие научные учреждения, а также отдельных ученых и специалистов;
4.2. Разрабатывать методические материалы и рекомендации для предприятий и организаций АПК по вопросам, отнесенным к его компетенции;
4.3. Запрашивать в установленном порядке от органов государственной власти, органов местного самоуправления муниципальных образований области, руководителей предприятий, организаций, учреждений, расположенных на территории Костромской области, информацию и документы, необходимые для выполнения своих задач и функций;
4.4. Проводить в установленном порядке совещания по вопросам, входящим в компетенцию Департамента, с привлечением руководителей и специалистов органов государственной власти, местного самоуправления, организаций и учреждений, а также представителей общественных объединений;
4.5. Заключать договоры и организовывать выполнение научно-исследовательских работ по вопросам развития и поддержки предприятий и организаций АПК области;
4.6. Создавать Коллегию и иные координационные и совещательные органы по вопросам функционирования предприятий агропромышленного комплекса, а также иным вопросам, входящим в компетенцию Департамента;
4.7. Учреждать ведомственные формы поощрения (грамоты, дипломы, благодарственные письма);
4.8. Выступать от своего имени истцом и ответчиком в суде;
4.9. Осуществляет иные права, установленные действующим законодательством.