5.1. Департамент возглавляет начальник, назначаемый и освобождаемый от должности губернатором области в установленном порядке;
(п. 5.1. в новой редакции постановления губернатора Костромской области N 558 от 29.12.2007 года)
5.2. Начальник департамента агропромышленного комплекса:
(п. 5.2. в новой редакции постановления губернатора Костромской области N 558 от 29.12.2007 года)
5.2.1. Несет ответственность за выполнение возложенных на Департамент задач и функций, состояние трудовой дисциплины, а также за создание условий по защите сведений, составляющих государственную тайну;
5.2.2. Руководит деятельностью Департамента по принципу единоначалия и несет персональную ответственность за ненадлежащее выполнение возложенных на Департамент задач;
5.2.3. В пределах установленной численности и фонда оплаты труда утверждает структуру и штатное расписание Департамента, а также смету расходов в пределах выделенных ассигнований;
5.2.4. Назначает и освобождает от должности государственных гражданских служащих, принимает на работу и увольняет работников Департамента;
5.2.5. Утверждает положения о структурных подразделениях;
5.2.6. Утверждает должностные регламенты и должностные инструкции, проводит аттестацию государственных гражданских служащих Департамента;
5.2.7. Издает приказы, обязательные для всех работников Департамента;
5.2.8. Действует без доверенности от имени Департамента, представляет его во всех государственных органах, органах местного самоуправления, учреждениях и организациях.
5.2.9. Издает распоряжения обязательные для курируемых организаций.
(п. 5.2.9. дополнен постановлением губернатора Костромской области N 462 от 15.06.2006 года)