Механизм реализации Программы определяется ее областным статусом. Координатор Программы - департамент здравоохранения Костромской области - формирует ежегодный план мероприятий, подлежащих финансированию, с определением исполнителей, объемов и источников финансирования. При изменении объемов бюджетного финансирования по сравнению с предусмотренными Программой, координатор в установленном порядке уточняет объем финансирования по каждому мероприятию, а также количество и перечень мероприятий Программы.
Исполнителям Программы выделяются средства на проведение конкретных программных мероприятий; размещаются государственные заказы в соответствии с Федеральным Законом от 21 июля 2005 года N 94-ФЗ "О размещении заказов на поставки товаров, выполнение работ, оказание услуг для государственных и муниципальных нужд".