3.1. Департамент возглавляет начальник департамента, назначаемый на должность и освобождаемый от должности губернатором Белгородской области по согласованию с Белгородской областной Думой.
3.2. Начальник Департамента является заместителем председателя правительства Белгородской области.
3.3. Организационная структура, штатное расписание и Положение о Департаменте утверждаются правительством Белгородской области.
3.4. Начальник Департамента:
3.4.1. Руководит деятельностью Департамента и несет персональную ответственность за осуществление возложенных на Департамент полномочий.
3.4.2. Устанавливает должностные обязанности и утверждает должностные регламенты сотрудников Департамента.
3.4.3. Представляет правительству Белгородской области кандидатуры для назначения на должности первого заместителя начальника Департамента, заместителей начальника Департамента.
3.4.4. Представляет правительству Белгородской области кандидатуры для назначения на должности подведомственных органов исполнительной власти Белгородской области.
3.4.5. Распределяет обязанности между своими заместителями.
3.4.6. Согласовывает проекты положений о подведомственных органах исполнительной власти Белгородской области.
3.4.7. В установленном порядке утверждает (согласовывает) штаты областных предприятий, организаций и учреждений, функционально подведомственных Департаменту, сметы расходов на их содержание в соответствии с выделенными на эти цели ассигнованиями.
3.4.8. В соответствии с действующим законодательством применяет к работникам Департамента меры дисциплинарных взысканий и поощрений.
3.4.9. Издает в пределах своей компетенции приказы, утверждает протоколы поручений начальника Департамента.
3.4.10. Выдаёт доверенности в соответствии с требованиями действующего законодательства.
3.4.11. В соответствии с утвержденным графиком проводит личный прием граждан, организует своевременное рассмотрение жалоб, заявлений и предложений граждан, принимает по итогам их рассмотрения необходимые меры.
3.4.12. По вопросам, отнесенным к сфере деятельности Департамента, представляет интересы Департамента и в установленном порядке интересы правительства Белгородской области, губернатора Белгородской области во взаимоотношениях с предприятиями, учреждениями, организациями и объединениями всех форм собственности.
3.5. Начальник Департамента имеет первого заместителя и заместителей. Количество заместителей начальника Департамента устанавливается правительством Белгородской области.
3.6. Первый заместитель начальника Департамента:
3.6.1. Исполняет обязанности начальника Департамента в период его отсутствия.
3.6.2. Представляет начальника Департамента по его поручению во взаимоотношениях с предприятиями, организациями, учреждениями, общественными объединениями, взаимодействующими с Департаментом, а также органами местного самоуправления муниципальных образований Белгородской области.
3.6.3. В пределах своей компетенции принимает решения по обеспечению выполнения задач, стоящих перед Департаментом.
3.7. Финансирование деятельности Департамента осуществляется за счёт средств, предусмотренных в областном бюджете.