Деятельность Комиссии основывается на принципах:
законности;
конфиденциальности рассматриваемой информации;
поддержки и взаимодействия всех заинтересованных государственных исполнительных органов области, территориальных органов федеральных органов исполнительной власти, органов местного самоуправления, учреждений, общественных и религиозных объединений;
гласности своей деятельности.