Поэтапный контроль за выполнением программных мероприятий осуществляет Губернатор Белгородской области. Контроль осуществляется на основе отчетов о реализации Программы, представляемых МРГ Губернатору Белгородской области ежеквартально.
МРГ проводит мониторинг процесса и результатов выполнения мероприятий Программы, формирует отчетность, которая ежеквартально контролируется Губернатором Белгородской области.
МРГ осуществляет контроль за составлением и реализацией планов мероприятий по реализации Программы ответственными органами исполнительной власти Белгородской области.
МРГ также осуществляет контроль за составлением и реализацией планов мероприятий Программы муниципальными образованиями Белгородской области по вопросам совместного ведения.