Государственным заказчиком - координатором и исполнителем мероприятий Программы является Министерство здравоохранения Республики Марий Эл.
Министерство здравоохранения Республики Марий Эл осуществляет руководство и текущее управление реализацией Программы, проводит анализ и формирует предложения по уточнению перечня программных мероприятий на очередной финансовый год, уточняет механизм реализации Программы и размер затрат на реализацию программных мероприятий.