В Республике Марий Эл существуют определенные ограничения транспортной инфраструктуры.
Протяженность автомобильных дорог общего пользования на территории Республики Марий Эл составляет 4 616,3 км, из них 230,3 км - дороги федерального значения, 4 386,0 км - дороги республиканского и межмуниципального значения, из которых 3 071,1 км - дороги с твердым и усовершенствованным покрытием и 1 314,9 км - грунтовые дороги.
На территории Республики Марий Эл расположено 1 860,7 км дорог местного значения, находящихся в собственности муниципальных образований, из которых только около 20,6 процента соответствуют нормативам.
Строительство дорог ведется в основном за счет субсидий из федерального бюджета. При этом недостаточность средств приводит к увеличению сроков строительства и не позволяет решить проблему отсутствия дорог в сельской местности.
Главная цель дорожной отрасли - обеспечение бесперебойного, безопасного, круглогодичного движения транспортных средств по дорогам с наименьшими затратами. В связи с этим основными направлениями деятельности в дорожном хозяйстве Республики Марий Эл на ближайшую перспективу являются:
сохранение существующей сети автомобильных дорог;
повышение технического уровня и улучшение эксплуатационных характеристик существующей сети автомобильных дорог, где главным является ликвидация участков, лишенных покрытия, изменение плана, профиля и улучшение проезжей части на особо опасных и загруженных участках федеральных и республиканских автомобильных дорог с целью обеспечения безопасного пропуска автомобильного транспорта.
В целях развития железнодорожной инфраструктуры Республики Марий Эл подписано Соглашение о взаимодействии и сотрудничестве на 2009 - 2011 годы между филиалом открытого акционерного общества "Российские железные дороги" Горьковской железной дорогой и Правительством Республики Марий Эл. Целью указанного Соглашения является взаимодействие Республики Марий Эл и открытого акционерного общества "Российские железные дороги" для удовлетворения потребностей населения, предприятий и организаций Республики Марий Эл в обеспечении железнодорожных перевозок, устойчивой работы открытого акционерного общества "Российские железные дороги", сбалансированности интересов Республики Марий Эл в социальной, производственной, финансовой, инвестиционной и других сферах деятельности.
Правительство Республики Марий Эл совместно с логистической компанией "Авто-Экспресс" и филиалом открытого акционерного общества "Трансконтейнер" на Горьковской железной дороге проводит работу по координации движения грузов товаропроизводителей Республики Марий Эл, что увеличит товарооборот и обеспечит снижение транспортных издержек в экономике. Соответственно повышается доступность услуг транспортного комплекса для населения, комплексная безопасность и устойчивость транспортной системы, улучшается инвестиционный климат и развитие рыночных отношений на транспорте.
Для реализации этих целей решаются следующие задачи: развитие путей сообщения (автомобильных дорог общего пользования, более широкое использование внутренних водных путей); развитие инфраструктуры республиканского аэропорта; плановое развитие транспортных узлов, погрузочно-разгрузочных и складских центров; повышение конкурентоспособности, обеспечение транспортной безопасности и развитие интегрированной системы контроля безопасности на транспорте с использованием современных информационных систем.
Данные мероприятия и взаимодействие с регионами Приволжского федерального округа позволяют рассматривать Республику Марий Эл как часть логистического комплекса Приволжского федерального округа, более эффективно использовать транспортный канал "восток-запад", повысить конкурентоспособность отраслей экономики Республики Марий Эл, оптимизировать грузовые потоки и маршруты движения транспорта, включить Республику Марий Эл в единую транспортную сеть России.
В целях обеспечения функционирования аэропорта и сохранения его в составе транспортной инфраструктуры Республики Марий Эл в 2007 году создано государственное учреждение Республики Марий Эл "Аэропорт Йошкар-Ола".
В настоящее время республиканский гражданский аэропорт "Йошкар-Ола", имеющий действующий аэродром класса "В", способен принимать воздушные суда типа ТУ-134 и классом ниже, а также вертолеты всех типов.
В целях повышения уровня функционирования аэропорта и сохранения его в транспортной сфере Республики Марий Эл принята республиканская целевая программа "Развитие гражданского аэропорта "Йошкар-Ола" на 2009 - 2015 годы", основными целями которой являются реконструкция аэропортового комплекса и укрепление материально-технической базы.
Модернизация аэропорта Республики Марий Эл позволит принимать транспортные воздушные суда типа ИЛ-76, что позволит включить аэропорт "Йошкар-Ола" в транспортный канал "восток-запад", учитывая наличие в столице Республики Марий Эл хорошо развитых производственных мощностей для обслуживания воздушных и наземных грузопотоков.