В настоящее время противотуберкулезная помощь на территории автономного округа оказывается 4 окружными противотуберкулезными диспансерами (городов Ханты-Мансийск, Сургут, Нижневартовск и п.г.т. Берёзово), имеющими на начало 2013 года общий коечный фонд в количестве 570, из которых 30 - хирургических и 40 – детских.
В соответствии с приказом Министерства здравоохранения России от 15 мая 2012 года N 543н "Об утверждении Положения об организации оказания первичной медико-санитарной помощи взрослому населению" контроль за лечением больных туберкулёзом в амбулаторных условиях осуществляют учреждения здравоохранения первичного звена.
Специализированную лечебно-профилактическую и реабилитационную медицинскую помощь детям дошкольного, младшего школьного возраста с неактивными формами туберкулеза и с повышенным риском заболевания туберкулезом оказывает казенное учреждение автономного округа "Детский противотуберкулезный санаторий им. Е.М. Сагандуковой" (г. Ханты-Мансийск). Функции, осуществляемые им, являются неотъемлемой частью комплекса мероприятий, направленных на организацию противоэпидемиологических мероприятий по сдерживанию туберкулезной инфекции среди детского контингента.
С учетом концепции развития здравоохранения Российской Федерации предполагается развитие трехуровневой системы (модели) организации оказания фтизиатрической помощи населению автономного округа.
Учреждения первого уровня - участковые больницы, врачебные амбулатории, фельдшерско-акушерские пункты, а также 17 противотуберкулезных кабинетов в составе городских и районных больниц.
Учреждения второго уровня - в качестве межрайонных центров предполагаются противотуберкулезные диспансеры г.г. Сургута и Нижневартовска, п.г.т. Березово, которые осуществляют на этапе стационарной помощи комплексное лечение больных туберкулезом, в основе которого лежат стандартные режимы химиотерапии с контролируемым приемом препаратов, а также оказывают специализированную амбулаторно-поликлиническую помощь консультативную помощь курируемым учреждениям здравоохранения.
Учреждение третьего уровня - головным учреждением фтизиатрической службы является бюджетное учреждение автономного округа "Ханты-Мансийский окружной клинический противотуберкулезный диспансер".