Механизм реализации Программы включает разработку и принятие нормативных правовых актов Ханты-Мансийского автономного округа - Югры, необходимых для выполнения Программы, ежегодное уточнение перечня программных мероприятий на очередной финансовый год и плановый период с уточнением затрат по программным мероприятиям в соответствии с мониторингом фактически достигнутых и целевых показателей реализации Программы, а также связанные с изменениями внешней среды, информирование общественности о ходе и результатах реализации Программы, финансировании программных мероприятий.
Программные мероприятия "Строительство объектов утилизации попутного нефтяного газа" и "Рекультивация нефтезагрязненных земель" реализуются через ежегодные и долгосрочные программы предприятий природопользователей за счет собственных средств.
Мероприятия подраздела "Строительство объектов для размещения и переработки отходов производства и потребления" реализуются муниципальными образованиями за счет средств бюджета автономного округа (субсидии), средств местных бюджетов и внебюджетных средств.
Конкурсы в рамках мероприятия "Организация и проведение экологических конкурсов" проводятся на основании положений, утверждаемых государственным заказчиком-координатором Программы, за исключением конкурсов на получение премий, порядок предоставления которых утверждается Правительством автономного округа.
Реализация Программы осуществляется на основе государственных контрактов для государственных нужд, заключаемых государственными заказчиками с исполнителями в установленном законодательством Российской Федерации порядке, а также на основе соглашений с органами местного самоуправления об обеспечении софинансирования мероприятий Программы.