Департамент образования администрации Города Томска осуществляет руководство и текущее управление реализацией подпрограммы, координирует деятельность ее участников (муниципальные дошкольные образовательные учреждения, в отношении которых функции и полномочия учредителя осуществляет департамент образования администрации Города Томска, а также частные дошкольные образовательные организации, осуществляющие предоставление дошкольного образования), своевременно (в соответствии с условиями и в сроки, установленные постановлением администрации Города Томска от 15.07.2014 №677 «Об утверждении порядка принятия решений о разработке муниципальных программ муниципального образования "Город Томск", их формирования, реализации, мониторинга и контроля») разрабатывает проекты муниципальных правовых актов, необходимых для ее реализации, проводит анализ и формирует предложения по рациональному использованию финансовых ресурсов подпрограммы.
Департамент образования администрации Города Томска организует взаимодействие с соответствующими структурными подразделениями Администрации Томской области, иными исполнительными органами государственной власти Томской области для обеспечения участия в государственных программах Российской Федерации и Томской области, реализации иных проектов и программ в целях исполнения настоящей подпрограммы. Порядок привлечения средств из бюджетов вышестоящих уровней определяется заключенными соглашениями о порядке и условиях предоставления соответствующих субсидий.
Контроль в отношении участников Подпрограммы, являющихся муниципальными образовательными учреждениями, подведомственными департаменту образования, осуществляется департаментом образования в форме контроля за выполнением муниципального задания на оказание муниципальных услуг (выполнение работ) муниципальными образовательными учреждениями, осуществляемого в порядке, предусмотренном муниципальным правовым актом администрации Города Томска.
Ответственность за реализацию подпрограммы, достижение показателей цели и задач несет департамент образования администрации Города Томска.