Куратором подпрограммы является заместитель Мэра Города Томска - Руководитель аппарата администрации Города.
Управление реализацией подпрограммы осуществляет ответственный исполнитель подпрограммы - комитет по вопросам муниципальной службы и кадрам администрации Города Томска.
Текущий контроль и мониторинг реализации подпрограммы осуществляет соисполнитель - департамент образования администрации Города Томска.
Комитет по вопросам муниципальной службы и кадрам администрации Города Томска и департамент образования администрации Города Томска самостоятельно, в пределах своей компетенции, организуют взаимодействие с соответствующими структурными подразделениями Администрации Томской области, с иными исполнительными органами государственной власти Томской области для обеспечения участия в государственных программах Российской Федерации и Томской области, реализации иных проектов и программ в целях исполнения настоящей подпрограммы.
Комитет по вопросам муниципальной службы и кадрам администрации Города Томска и департамент образования администрации Города Томска, ежегодно, в срок до 25 января года следующего за отчетным, представляют в управление информатизации и муниципальных услуг администрации Города Томска отчет о реализации подпрограммы «Развитие муниципальной службы и кадрового потенциала муниципальных учреждений» с разбивкой по мероприятиям подпрограммы по итогам отчетного года в форме, аналогичной приложению 8 к Порядку принятия решений о разработке муниципальных программ муниципального образования «Город Томск», их формирования, реализации, мониторинга и контроля, утвержденному постановлением администрации Города Томска от 15.07.2014 №677.