Управление подпрограммой, а также реализация мероприятий подпрограммы осуществляет управление экономического развития администрации Города Томска.
Куратором подпрограммы является заместитель Мэра Города Томска по экономическому развитию и инновациям Е.А.Лазичева.
Участниками подпрограммы являются субъекты малого и среднего предпринимательства в инновационной сфере, объекты инновационной инфраструктуры, вузы, ссузы, молодые ученые, аспиранты, студенты, школьники.
Текущий контроль и мониторинг реализации подпрограммы осуществляет управление экономического развития администрации Города Томска.
В порядке, установленном нормативными правовыми актами Администрации Томской области, муниципальное образование «Город Томск» участвует в отборе муниципальных образований Томской области для предоставления из областного бюджета субсидий местным бюджетам муниципальных образований Томской области.
Порядок и условия предоставления субсидий из бюджета муниципального образования «Город Томск» по мероприятиям, предусмотренным подпрограммой, утверждаются отдельными нормативными правовыми актами администрации Города Томска.
Внесение изменений в подпрограмму осуществляется путем принятия соответствующего постановления администрации Города Томска.
Подпрограмма подлежит приведению в соответствие с решением Думы Города Томска о бюджете муниципального образования «Город Томск» на очередной финансовый год и плановый период в срок не позднее двух месяцев со дня вступления его в силу.
В случае изменения бюджетных ассигнований на реализацию муниципальных программ решением Думы Города Томска о бюджете управление экономического развития администрации Города Томска обеспечивает внесение изменений в подпрограмму, включая корректировку перечня мероприятий, показателей целей и задач, в течение 15 календарных дней после принятия решения о внесении изменений в бюджет.
Реализация подпрограммы освещается в средствах массовой информации.