В рамках Программы предусмотрена реализация следующих подпрограмм:
1) подпрограмма 1 "Чистый город" (приложение 1);
2) подпрограмма 2 "Содержание особо охраняемой природной территории местного значения "Озерный комплекс пос.Самусь ЗАТО Северск" (приложение 2);
3) подпрограмма 3 "Обеспечивающая подпрограмма".