Контроль за реализацией ДЦП осуществляет заместитель Губернатора Томской области по социальной политике.
Текущий контроль за реализацией ДЦП осуществляют Департамент по вопросам семьи и детей Томской области, Департамент здравоохранения Томской области, Департамент общего образования Томской области, Департамент по культуре и туризму Томской области, Департамент по молодежной политике, физической культуре и спорту Томской области.
Соисполнители ДЦП ежеквартально, до 5-го числа месяца, следующего за отчетным периодом, представляют заказчику ДЦП отчетность о реализации ДЦП и об использовании финансовых ресурсов.
Департамент по вопросам семьи и детей Томской области представляет ежеквартально отчет о реализации ДЦП в Департамент экономики Администрации Томской области по установленным формам и в установленные сроки.