Государственная программа реализуется в рамках пяти подпрограмм, которые обеспечивают достижение целей и решение задач государственной программы.
Реализация подпрограммы 1 "Модернизация и развитие транспортного комплекса Саратовской области" обеспечивает достижение цели по созданию условий для устойчивого функционирования транспортной системы области, обеспечивающей эффективную работу всех видов транспорта и улучшение качества транспортного обслуживания населения области, а также решение задачи по развитию и модернизации всех видов транспорта на территории области и обеспечению перевозок пассажиров по социально значимым маршрутам, ценовой доступности транспортных услуг.
Реализация подпрограммы 2 "Модернизация и развитие автомобильных дорог общего пользования регионального и межмуниципального значения Саратовской области" обеспечивает достижение цели по удовлетворению спроса населения и потребностей экономики Саратовской области в разветвленной сети автомобильных дорог общего пользования регионального и межмуниципального значения, а также мостов и иных искусственных сооружений на них в соответствии с требованиями безопасности дорожного движения, а также решение задач по обеспечению функционирования и развития сети автомобильных дорог/мостов регионального и межмуниципального значения, формированию единой дорожной сети круглогодичной доступности для населения.
Реализация подпрограммы 3 "Повышение безопасности дорожного движения в Саратовской области" обеспечивает достижение цели по обеспечению безопасности дорожного движения, а также решение задачи по снижению уровня аварийности на дорогах и обеспечению функционирования автоматизированной системы фото-видео фиксации нарушений правил дорожного движения.
Реализация подпрограммы 4 "Внедрение спутниковых навигационных технологий с использованием системы ГЛОНАСС и других результатов космической деятельности в интересах социально-экономического и инновационного развития Саратовской области" обеспечивает достижение цели по расширению внедрения и использования спутниковых навигационных технологий с использованием системы ГЛОНАСС в деятельности транспортных предприятий, а также решение задачи по созданию регионального навигационно-информационного центра Саратовской области с единой многофункциональной навигационной геоинформационной платформой с использованием аппаратуры спутниковой навигации ГЛОНАСС.
Реализация подпрограммы 5 "Развитие рынка газового моторного топлива в Саратовской области" обеспечивает достижение цели по созданию условий для использования компримированного природного газа в качестве моторного топлива путем модернизации материально-технической базы парка автомобильного транспорта в результате перевода на использование компримированного природного газа в качестве моторного топлива и развитие объектов газозаправочной инфраструктуры.