К полномочиям уполномоченного органа относятся:
1) подготовка и организация встреч, консультаций и иных мероприятий с представителями государственно-территориальных, административно-территориальных и муниципальных образований Финляндской Республики, а также с согласия Правительства Российской Федерации с органами государственной власти Финляндской Республики;
2) участие в разработке и реализации международных программ приграничного сотрудничества, проектов международных программ приграничного сотрудничества;
3) оказание содействия органам местного самоуправления муниципальных образований и координация деятельности указанных органов в сфере приграничного сотрудничества;
4) формирование перечня соглашений о приграничном сотрудничестве Республики Карелия;
5) получение перечней соглашений о приграничном сотрудничестве муниципальных образований и формирование перечня соглашений о приграничном сотрудничестве муниципальных образований;
6) регистрация соглашений о приграничном сотрудничестве муниципальных образований в порядке, определенном статьей 6 настоящего Закона;
7) сбор информации об осуществлении международных и внешнеэкономических связей Республики Карелия и муниципальных образований с субъектами приграничного сотрудничества Финляндской Республики по вопросам приграничного сотрудничества и о результатах осуществления таких связей;
8) осуществление иных полномочий в сфере приграничного сотрудничества в соответствии с международными договорами Российской Федерации, Федеральным законом "Об основах приграничного сотрудничества", иными федеральными законами и другими нормативными правовыми актами Российской Федерации.