Основными рисками реализации подпрограммы являются социально-психологические риски. Риски связаны с сопротивлением персонала медицинских организаций преобразованиям в системе здравоохранения. Для минимизации риска необходимо широкое публичное обсуждение проектов нормативных актов, апробация инициатив на «пилотных» площадках и представление результатов апробации общественности. Также преодоление рисков может быть осуществлено путем усиления методической и кадровой работы Министерства здравоохранения Удмуртской Республики с медицинскими организациями.
Правовые риски. Заключение эффективных контрактов будет осуществляться в соответствии с требованиями трудового законодательства Российской Федерации. Эффективный контракт является новацией, в связи с чем может возникнуть необходимость внесения изменений в законодательство Российской Федерации, а затем - в принятии подзаконных актов. Для минимизации риска будет осуществляться мониторинг планируемых изменений федерального законодательства.
Макроэкономические риски. Снижение темпов роста экономики, высокая инфляция могут негативно повлиять на функционирование системы здравоохранения, затормозить структурные преобразования в ней.