Основным риском реализации подпрограммы является риск неполного и несвоевременного финансового обеспечения за счет бюджетных средств. Данный риск может возникнуть в связи с ухудшением экономической ситуации. Однако, учитывая положительный прогноз развития экономики республики на ближайший период, риск сбоев в реализации подпрограммы по причине недофинансирования можно считать умеренным.
Существует риск неэффективного использования бюджетных средств. В качестве меры для управления риском осуществляется внутренний финансовый контроль.