Существует риск сокращения объёма финансирования республиканской целевой программы «Развитие водохозяйственного комплекса Удмуртской Республики на 2013-2017 годы», реализуемой в рамках подпрограммы.
Способом управления финансовым риском является ежегодная корректировка плана мероприятий республиканской целевой программы «Развитие водохозяйственного комплекса Удмуртской Республики на 2013-2017 годы» с учетом финансирования, предусмотренного законом о бюджете Удмуртской Республики на соответствующий финансовый год, и корректировка показателей в зависимости от достигнутых результатов.
Существует риск нецелевого и неэффективного использования бюджетных средств. В качестве мер для управления риском будут применяться меры финансового контроля, мониторинг реализации мероприятий подпрограммы.