Мероприятия по обеспечению деятельности государственного заказчика и соисполнителей государственной программы осуществляются путем выполнения государственного задания на оказание государственных услуг. Финансовое обеспечение государственных заданий осуществляется в форме субсидий из областного бюджета Ульяновской области Министерству в рамках выделенных бюджетных ассигнований.
Министерство является исполнительным органом государственной власти Ульяновской области, осуществляющим функции по контролю в сфере охраны здоровья граждан в Ульяновской области, а также по оказанию государственных услуг; осуществляет функции и полномочия учредителя в отношении государственных медицинских организаций, организует работу и координирует их деятельность в пределах своих полномочий; осуществляет функции государственного заказчика, главного распорядителя и получателя средств областного бюджета Ульяновской области, главного администратора доходов.