Государственным заказчиком Программы является Департамент ветеринарии Ульяновской области.
Общее управление и контроль за реализацией программных мероприятий осуществляет Департамент ветеринарии Ульяновской области.
Государственный заказчик Программы несет ответственность за своевременное выполнение мероприятий Программы и целевое, эффективное и правомерное использование выделенных бюджетных средств.
Руководитель Программы несет ответственность за реализацию и конечные результаты Программы, целевой характер финансирования, эффективность и результативность выполняемых программных мероприятий, определяет формы и методы управления реализацией Программы.
Департамент ветеринарии Ульяновской области ежеквартально до 20 числа месяца, следующего за отчетным кварталом, представляет в Министерство экономики и планирования Ульяновской области отчеты о ходе реализации Программы и эффективности использования бюджетных средств.