Управление Программой осуществляет Государственный комитет Псковской области по инвестициям и пространственному развитию.
Контроль за ходом реализации Программы осуществляется Государственным комитетом Псковской области по инвестициям и пространственному развитию и Государственным финансовым управлением Псковской области.