Экологическая доктрина Российской Федерации, одобренная распоряжением Правительства Российской Федерации от 31 августа 2002 года N 1225-р, рассматривает развитие системы ООПТ как одно из ключевых направлений государственной политики в области экологии. Миссия всех ООПТ едина - это сохранение биологического и ландшафтного разнообразия как основы биосферы.
В настоящее время в Архангельской области расположено 111 ООПТ:
8 ООПТ федерального значения - 1 заповедник, 4 национальных парка, 2 дендрологических сада, 1 ботанический сад;
99 ООПТ регионального значения - 66 памятников природы, 33 заказника (22 биологических, 8 ландшафтных, 2 комплексных и 1 геологический), общая площадь которых составляет 1,6 млн. га;
4 ООПТ местного значения, общая площадь которых составляет 303,43 га.
Общая площадь всех ООПТ в Архангельской области, включая акваторию водных объектов, составляет 11,2 млн. га.
Наиболее ценными экосистемами в пределах Архангельской области являются малонарушенные лесные массивы.
Высокую ценность представляют карстовые ландшафты. Самым значительным участком с лиственничными лесами и таежными редколесьями, произрастающими на участках открытого карста - шелопняковых полях, является Чугский государственный природный ландшафтный заказник регионального значения. Шелопняковые поля, подобные известняковым мостовым Канады и Скандинавии, образуют в заказнике значительные площади. Подобного развития шелопняковых полей нет ни в других карстовых массивах Архангельской области, ни в карсте мира в целом.
На территории Приморского государственного природного ландшафтного заказника регионального значения (далее - Приморский заказник) и Соянского государственного природного биологического заказника регионального значения (далее - Соянский заказник) имеются выходы на поверхность отпечатков организмов вендского периода. Ископаемые остатки вендских животных встречаются редко, единичные местонахождения - в Австралии, Южной Африке, Северной Америке, на севере Европы - в Архангельской области. Ценность Беломорских вендских ископаемых заключается в их наилучшей сохранности. Именно эти материалы положили конец многолетнему спору среди исследователей и показали, что это были пусть и необычные, но настоящие животные, а не растения. В Соянском заказнике сохраняются также ископаемые насекомые пермского периода.
Наибольшим флористическим разнообразием характеризуется флора Беломорско-Кулойского флористического района, на территории которого расположены Приморский и Соянский заказники. При этом в Соянском заказнике произрастает 35 процентов флоры данного флористического района, а в Приморском заказнике - 57 процентов. Это достаточно высокий показатель, учитывая, что данные заказники находятся в пределах северной тайги. Высоким показателем биологического разнообразия характеризуется территория Кожозерского флористического района, где расположен Кожозерский государственный природный ландшафтный заказник регионального значения (далее - Кожозерский заказник). Стоит отметить высокое обилие в нем видов семейства орхидные, большинство из которых занесены в Красную книгу Архангельской области.
ООПТ регионального значения играют важную роль в сохранении рыбных запасов, по территории заказников протекают 18 семужье-нерестовых рек. Значительная часть данных рек располагается в Соянском и Приморском заказниках, имеющих наибольшие площади охраны. При этом режим использования территории заказников не вносит дополнительных ограничений к правилам рыболовства, ограничивая лишь доступ транспорта к водным объектам, что представляет особую важность в период нереста рыб. Кроме того, обеспечивается дополнительная охрана водных биологических ресурсов на ООПТ, в границах которых располагаются крупные озера или их части. Так, задачу сохранности биоресурсов озер Лача и Кожозеро решают одноименные заказники. В Приморском заказнике охраняется редкая экосистема Товских озер с изолированными популяциями краснокнижного озерного многотычинкового сига.
Особое внимание уделяется сохранению и восстановлению численности популяции северного дикого оленя, занесенного в Красную книгу Архангельской области. Для естественного протекания жизненного цикла этих животных им необходимы длительные сезонные миграции или кочевки. Так, большая часть стад лесного северного оленя обитает в зимний период в борах надпойменной террасы Северной Двины в Шиловском государственном природном биологическом заказнике регионального значения. Усиление охранных мероприятий в настоящее время требуется для группы лесного северного оленя, которая оказалась изолированной от остальной части западной популяции европейского лесного северного оленя, в Водлозерском национальном парке и Кожозерском заказнике. Промедление может привести не только к сокращению численности и изоляции группы северных оленей на западе Архангельской области, но и к изменению в экологии и этологии вида.
Система ООПТ охватывает территории, имеющие природоохранную ценность международного значения. В рамках решений Конвенции о водно-болотных угодьях, имеющих международное значение главным образом в качестве местообитаний водоплавающих птиц, к ключевым орнитологическим территориям России отнесены: Беломорский государственный природный биологический заказник регионального значения, Двинской государственный природный биологический заказник регионального значения, Лачский государственный природный биологический заказник регионального значения (далее - Лачский заказник), Кулойский государственный природный биологический заказник регионального значения. Природоохранная деятельность на их территории направлена на максимальный эффект для сохранения видов, подвидов или популяций птиц. Так, на территории Лачского заказника охраняется 132 вида птиц, среди которых 8 занесены в Красную книгу Архангельской области. Ежегодно в период весенних миграций через дельтовую область Северной Двины пролетают от 80 до 320 тыс. особей нескольких видов гусей, 60 - 100 тыс. казарок, 11 - 17 тыс. лебедей.
С целью охраны и воспроизводства охотничье-промысловых видов животных, сохранения и восстановления численности редких и исчезающих видов зверей и птиц, ценных в хозяйственном, научном и эстетическом отношении, а также среды их обитания на территории Архангельской области в заказниках проводятся специальные биотехнические мероприятия.