Ответственными за реализацию Программы являются:
государственное управление ветеринарии Краснодарского края;
департамент сельского хозяйства и продовольствия Краснодарского края;
управления сельского хозяйства муниципальных образований Краснодарского края, руководители сельскохозяйственных организаций Краснодарского края, владельцы животных.
Основные исполнители Программы совместно с органами местного самоуправления разрабатывают и утверждают ежегодные планы работ по выполнению соответствующих мероприятий, осуществляют организацию, контроль и обеспечение выполнения в полном объеме предусмотренных Программой работ, подготавливают и направляют государственному заказчику обоснованные предложения по финансированию конкретных мероприятий Программы.