Для решения поставленных задач департамент осуществляет следующие функции:
3.1. Организует разработку, с привлечением заинтересованных ведомств, программ по обеспечению экономической безопасности, законности, правопорядка, противодействию наркомании, борьбе с незаконным оборотом наркотических средств и психотропных веществ, профилактике правонарушений на территории Краснодарского края.
3.2. Подготавливает руководству администрации края информацию о состоянии в сфере борьбы с преступностью, незаконным оборотом наркотических средств и психотропных веществ, обеспечения экономической безопасности и профилактики правонарушений.
3.3. Разрабатывает предложения руководству администрации края по защите экономики, укреплению правопорядка, профилактике правонарушений, противодействию организованной преступности и коррупции, злоупотреблению наркотическими средствами, психотропными веществами и их незаконному обороту.
3.4. Совместно с заинтересованными органами власти выявляет причины и условия возникновения кризисных ситуаций в отраслях экономики, подготавливает предложения по их предотвращению.
3.5. Анализирует практику применения законодательства Российской Федерации по вопросам помилования.
3.6. Разрабатывает предложения главе администрации края по вопросам, связанным с применением законодательства Российской Федерации по вопросам помилования.
3.7. Организует взаимодействие Совета безопасности при главе администрации Краснодарского края и Антитеррористической комиссии Краснодарского края с территориальными органами федеральных органов исполнительной власти, органами исполнительной власти Краснодарского края, органами местного самоуправления и организациями независимо от форм собственности, а также общественными объединениями при проведении единой государственной политики в сфере профилактики терроризма, а также минимизации и ликвидации последствий его проявлений, обеспечения региональной безопасности на территории края.
3.8. Разрабатывает основные направления стратегии обеспечения региональной безопасности в крае, вносит предложения главе администрации Краснодарского края по реализации принятых решений Совета безопасности при главе администрации Краснодарского края и Антитеррористической комиссии Краснодарского края.