Контроль за ходом реализации Программы осуществляют администрация Краснодарского края и Законодательное Собрание Краснодарского края. Конкретные формы и методы управления реализацией Программы определяются администрацией Краснодарского края с учетом структуры Программы.
Администрация Краснодарского края вправе передавать часть функций государственного заказчика Программы соответствующим органам исполнительной власти Краснодарского края и организациям в порядке, установленном законодательством Российской Федерации.
Координация деятельности исполнителей Программы осуществляется департаментом строительства Краснодарского края и управляющей компанией Программы. Текущее управление и оперативный контроль за выполнением подпрограмм и мероприятий, включенных в состав Программы, осуществляются исполнительными органами Краснодарского края в соответствии с приложением 1.
Исполнители подпрограмм и мероприятий Программы осуществляют ежемесячный мониторинг их выполнения и при выявлении случаев неисполнения или иных нарушений принимают соответствующие меры, а также ежеквартально представляют департаменту строительства Краснодарского края (координатор Программы) сводную информацию о ходе выполнения Программы.
Один раз в полугодие координатор Программы с участием соответствующих органов исполнительной власти Краснодарского края - исполнителей подпрограмм и мероприятий Программы - подготавливает и представляет в администрацию Краснодарского края и Законодательное Собрание Краснодарского края доклад о ходе реализации Программы с внесением предложений по корректировке намеченных мероприятий.