К полномочиям исполнительного органа государственной власти Краснодарского края в сфере организации, охраны и использования особо охраняемых природных территорий относятся:
- установление категорий особо охраняемых природных территорий краевого значения;
- образование по представлению специально уполномоченных органов государственной власти Краснодарского края в области охраны окружающей среды и по согласованию с органами местного самоуправления особо охраняемых природных территорий краевого значения, утверждение и изменение их границ и определение режима охраны, утверждение положений об этих территориях;
- согласование решений об организации особо охраняемых природных территорий с правительством Российской Федерации в случаях необходимости изъятия земельных участков или акваторий, используемых для общегосударственных нужд;
- представление правительству Российской Федерации предложений о предоставлении расположенным в пределах края территориям, нуждающимся в особой охране, статусов государственных природных заповедников, национальных парков, государственных природных заказников и памятников природы федерального значения;
- принятие решений о резервировании земельных участков на основании принятых схем развития и размещения особо охраняемых природных территорий, которые предполагается объявить особо охраняемыми природными территориями, и об ограничении на них хозяйственной деятельности;
- принятие решений об образовании на землях, прилегающих к особо охраняемым природным территориям, охранных зон или округов, в том числе округов санитарной (горно - санитарной) охраны, с регулируемым режимом хозяйственной деятельности и утверждение положений об охранных зонах и округах;
- организация ведения государственного кадастра и мониторинга особо охраняемых природных территорий, находящихся на территории Краснодарского края;
- определение направлений расходования средств на охрану особо охраняемых природных территорий края в пределах, определенных краевым бюджетом на соответствующий год;
- передача органам местного самоуправления отдельных полномочий по организации, охране и использованию особо охраняемых природных территорий;
исполнительный орган государственной власти Краснодарского края может рассматривать иные вопросы в сфере особо охраняемых природных территорий в соответствии с установленной компетенцией.