Общий объем финансирования Программы составляет 290,1 миллиона рублей, в том числе планируется привлечение средств из федерального бюджета в объеме 213,9 миллиона рублей, из краевого бюджета - 76,2 миллиона рублей, из них: в 2005 году - 12,5 миллиона рублей, в 2006 году - 12,7 миллиона рублей, в 2007 году - 17,0 миллионов рублей, в 2008 году - 17,0 миллионов рублей, в 2009 году - 17,0 миллионов рублей.
Средства краевого бюджета будут направлены на приобретение ветеринарно-санитарной дезинфекционной техники, спецавтотранспорта, приборов, оборудования и других товаров ветеринарного назначения для государственных ветеринарных учреждений, оплату услуг по доставке, хранению, выдаче биопрепаратов, приобретение дезинфицирующих, дезинсекцирующих средств, питательных сред и реактивов для ветеринарных лабораторий края, приобретение инъекторов и противопаразитарных препаратов.