Муниципальные унитарные предприятия не имеют права собственности на закрепленное за ними собственником (муниципальным образованием) имущество. Согласно Гражданскому кодексу Российской Федерации собственник имущества унитарного предприятия обладает значительными полномочиями по управлению данным унитарным предприятием. В частности, собственник имеет право на получение части прибыли от использования имущества, находящегося в хозяйственном ведении унитарного предприятия. Но на практике органы местного самоуправления не в полной мере пользуются своими правами, не осуществляют надлежащий контроль за эффективностью управления унитарными предприятиями, за сохранностью имущества и использованием его по назначению. Недостаточная эффективность деятельности унитарных предприятий приводит к недополучению доходов в местный бюджет.
Для повышения эффективности управления муниципальными унитарными предприятиями, своевременного выявления негативных процессов, их оценки, предупреждения и устранения последствий должен проводиться мониторинг финансово-хозяйственной деятельности унитарных предприятий.