На территории Усть-Кубинского лесничества отсутствуют особо охраняемые природные территории федерального и регионального значения, но имеются охраняемые болота. В таблице 1.1.6.1 представлен перечень охраняемых болот.
Клюквенные и водоохранные болота являются ценными ягодниками и имеют важное водоохранное значение. На территории охраняемых болот запрещены все виды работ, связанные с изменением гидрологического режима и нарушением их целостности.