Контроль за реализацией Программы осуществляется департаментом здравоохранения области и первым заместителем Губернатора области, курирующим соответствующую отрасль.
Департамент здравоохранения области, департамент труда и социального развития области несут ответственность за конечные результаты реализации Программы, целевое и эффективное использование выделяемых средств и представление в установленном порядке аналитической информации.
Для обеспечения мониторинга и контроля за ходом реализации Программы департамент здравоохранения области ежеквартально до 20 числа месяца, следующего за отчетным кварталом, представляет первому заместителю Губернатора области, курирующему соответствующую отрасль, а в копии - аналитическому комитету Правительства области и контрольно-аналитическому управлению Правительства области информацию о выполнении мероприятий Программы, содержащую анализ положительных результатов, а также причины недостатков и нерешенных проблем.
Кроме того, департамент здравоохранения области осуществляет подготовку и представление аналитической информации в сроки, установленные пунктом 2 постановления Правительства области от 29 декабря 2003 года N 1236.