Контроль за реализацией Программы осуществляют Департамент развития муниципальных образований области и вице-губернатор области, курирующий отрасль.
Контроль предусматривает сопровождение реализации Программы Департаментом развития муниципальных образований области, внутриведомственный контроль и проведение комплексных проверок исполнения мероприятий Программы с участием представителей органов исполнительной государственной власти.
Для обеспечения мониторинга и контроля за ходом реализации Программы Департамент развития муниципальных образований области (заказчик-координатор) до 20 числа месяца, следующего за отчетным кварталом, представляет вице-губернатору области, а в копии в департамент экономики Правительства области и контрольно-аналитическое управление Правительства области информацию о выполнении мероприятий Программы, содержащую анализ положительных результатов, а также причины недостатков и нерешенных проблем.
Кроме того, Департамент развития муниципальных образований области осуществляет подготовку и представление информации в соответствии с пунктом 2 постановления Правительства области от 29 декабря 2003 года N 1236.